Предназначены для преобразования одних ресурсов (избыточных) в другие (недостающие).
Всего существует три вида алхимических операций, которыми могут быть оснащены корабли-алхимики: Alchemy, Refinery, Advanced Refіnery. Обычно корабль может выполнять только одну алхимическую операцию, однако в PHOST 4.x стало возможным совмещать в одном корабле сразу две функции: Alchemy+Refinery или Alchemy+Advanced Refіnery. Если в корабле совмещены функции Refinery+Advanced Refіnery корабль будет работать только в режиме Advanced Refіnery.
Корабли-алхимики не требуют топлива для своей работы!

Корабль с функцией Alchemy может преобразовывать оборудование в минералы. Химическая реакция:

3 Supplies –> 1 Дюраниум

3 Supplies –> 1 Тританиум

3 Supplies –> 1 Молибденум

Обычно все три реакции синтеза идут паралельно, поэтому 9 модулей оборудования дают на выходе 1кТ Дюраниума, 1кТ Тританиума и 1кТ Молибденума.
Однако с помощью специальных дружественных кодов можно управлять операциями синтеза и производить только определенные минералы. (ald - производим только Дюраниум, alt - производим только Тританиум, alm - производим только Молибдениум).

Корабль с функцией Refinery может преобразовывать минералы плюс оборудование в нейтронное топливо (нейтрониум).
Hиже приводятся три алхимические реакции, используемые этим кораблем:

1 Дюраниум + 1 Модуль оборудования –> 1 Нейтрониум

1 Молибденум + 1 Модуль оборудования –> 1 Нейтрониум

1 Тританиум + 1 Модуль оборудования –> 1 Нейтрониум

На корабле автоматически выполняется функция синтеза, если выполняются все три ниже приведенных условия:
1) Hа борту корабля есть по меньшей мере одна Кт дюраниума, или молибденума, или тританиума.
2) Hа борту корабля есть по меньшей мере одна Кт оборудования.
3) В топливных танках есть место по меньшей мере для одной Кт топлива.

Корабль с функцией Advanced Refinery может преобразовывать минералы плюс оборудование в нейтронное топливо (нейтрониум) без использования модулей оборудования, т.е. на корабле выполняются следующие алхимические реакции:

1 Дюраниум –> 1 Нейтрониум

1 Молибденум –> 1 Нейтрониум

1 Тританиум –> 1 Нейтрониум